Поскольку Модельный уголовный кодекс является рекомендательным актом, в нем отсутствует ненужная конкретизация и детализация. Так, в санкциях статей Особенной части, указывается лишь категория, к которой относится соответствующее преступление, что определяет только верхнюю или нижнюю границу наказания за это преступление. Конкретные же виды и размеры наказания устанавливаются национальными кодексами государств. По этой же причине в Кодексе не определяются виды исправительно-трудовых учреждений, минимальный и максимальный размеры штрафа, процент удержания из заработной платы в доход государства при исправительных работах, виды принудительных мер медицинского характера, не раскрываются понятия крупного размера хищения, взятки и крупного ущерба при преступлениях против порядка осуществления экономической деятельности и ряд других понятий. С учетом специфики так называемых воинских преступлений было признано нецелесообразным включение в Модельный уголовный кодекс соответствующего раздела.
В Модельном уголовном кодексе учтены наиболее удачные решения, достигнутые в процессе законопроектной работы в Российской Федерации, Республике Узбекистан, Украине, Республике Беларусь, Республике Казахстан а также опыт законодательства США, Франции, Германии, Нидерландов, Италии и ряда других стран.
По сложившейся традиции Модельный УК состоит из Общей и Особенной частей. Триста сорок одна статья Кодекса распределяются по тринадцати разделам, включающим тридцать четыре главы.
В Общей части выделены разделы: «Уголовный закон», «Преступление», «Наказание», «Освобождение от уголовной ответственности и наказания», «Особенности уголовной ответственности и наказания несовершеннолетних». В основу построения системы Особенной части положены межродовой и родовой объекты, позволяющие объединить ряд преступлений в соответствующих разделах и главах Кодекса. Охраняемыми уголовным законом родовыми объектами определены: мир и безопасность человечества; жизнь и здоровье человека, личная свобода; конституционные права и свободы человека и гражданина; семья и воспитание несовершеннолетних; общественная безопасность; здоровье населения; безопасность движения и эксплуатации транспорта; экологическая безопасность и природная среда; общественный порядок и нравственность; собственность; порядок осуществления предпринимательской и иной экономической деятельности; информационная безопасность; конституционный строй и безопасность государства; интересы публичной службы; порядок управления; правосудие. Именно в такой последовательности находятся главы Особенной части модельного УК, исходя из иерархии задач уголовного законодательства и приоритетов охраняемых уголовным законом ценностей.
Обращает на себя внимание перемещение на первое место в системе Особенной части Модельного УК группы статей, содержащих описание признаков преступлений против мира и безопасности человечества. Разработчики Модельного кодекса исходили при этом из положения, что жизнь, здоровье, права и свободы человека, иные общественные ценности и интересы могут быть обеспечены только при условии сохранения мира и безопасности человечества в целом. Эта идея воспринята в новых уголовных кодексах Азербайджанской Республики, Республики Беларусь.
Раздел «Преступления против общественной безопасности и здоровья населения» с учетом опять-таки значимости и социального смысла этих преступлений в системе Модельного УК расположен сразу же за разделом «Преступления против человека».
Следует также отметить, что в Модельном УК в названиях разделов и глав Особенной части удалось довольно точно отразить объекты преступных посягательств и уголовно-правовой охраны, избежав такого рода неопределенных формулировок, как «преступления в сфере экономической деятельности», «экологические преступления», «преступления в сфере компьютерной информации» и т. п., предложив соответственно иные названия: «преступления против порядка осуществления предпринимательской и иной экономической деятельности», «преступления против экологической безопасности и природной среды», «преступления против информационной безопасности» и т. д.
