8 сентября 1664 года Стайвесант и его небольшой гарнизон, понуждаемые волей народа, вышли из форта Амстердам с "бьющими барабанами и развевающимися знаменами" и официально сдались Николлсу и английским войскам. Войска голландской компании сели на корабли и вскоре отправились в Европу, оставив Англию в качестве неоспоримой политической силы в бывшей голландской колонии. Николлс, новый политический хозяин, объезжал свои новые владения, довольный своим достижением - он захватил всю колонию без единого выстрела, предоставив Англии юрисдикцию не только над бывшими Новыми Нидерландами, но и над всем восточным побережьем Северной Америки. Он незамедлительно объявил, что отныне форт Амстердам будет называться фортом Джеймс, форт Оранж, расположенный в глубине реки Гудзон, - фортом Олбани, а город Новый Амстердам, да и вся Новая Голландия, отныне будет называться Новыми Нидерландами.
Йорк. Узнав об этом, король Англии Карл II написал своей сестре во Францию: "Вы, наверное, слышали о том, что мы взяли Новый Амстердам. Это очень важное место... Мы овладели им, и теперь оно называется Нью-Йорк". В то время население всей колонии составляло около девяти тысяч человек, из которых несколько тысяч жили в Новом Амстердаме на острове Манхэттен.
Менее чем через год, в феврале 1665 года, Карл II объявил войну Объединенным провинциям, используя в качестве повода резню в Амбоне, продолжавшуюся несколько десятилетий. Это стало началом Второй англо-голландской войны. Великие флоты двух стран приготовились к очередному раунду сражений, а Стайвесант получил от Девятнадцати пунктуальный приказ немедленно возвращаться в Европу. Должно быть, он знал, что на него хотят свалить вину за бесславную сдачу Новых Нидерландов англичанам, и принял оборонительные меры. Садясь на корабль в Амстердаме, бывший генеральный директор вооружился документами, подтверждающими его личность как "честного владельца и патриота провинции, а также сторонника реформированной религии". Лидеры общины Общности Новых Нидерландов, его партнеры по юридическим поединкам на протяжении последнего десятилетия, решили оставить прошлое в прошлом и объединились, чтобы совместно защищать свою капитуляцию перед англичанами.
Капитуляция, утверждали они, была их единственным выходом: "Достопочтенный Петрус Стайвесант, тогдашний генеральный директор Новых Нидерландов, сразу же после прибытия и пребывания английских фрегатов использовал все возможные средства, чтобы побудить и вдохновить бургеров города Новый Амстердам и жителей поселений, особенно на Лонг-Айленде, на любое возможное сопротивление; конечно, защищать город и форт Новый Амстердам, пока он способен к обороне, но что ни те, ни другие не могут быть убеждены сделать это, поскольку это невозможно, с любой надеждой на хороший результат."
Тем не менее, когда Стайвесант сошел с корабля в Амстердаме, Вест-Индская компания публично обвинила его в трусости и некомпетентности, а также возложила на него вину за потерю колонии англичанами. Эти обвинения он решительно опроверг в Генеральном штате. Компания, которой он служил всю свою взрослую жизнь, ополчилась на него, заявив, что он "позволил духовным лицам, женщинам и трусам оседлать себя, чтобы отдать англичанам то, что он мог защитить с репутацией, ради спасения своих частных владений". Как и в случае с ван дер Донком, компания отказала Стайвесанту в праве вернуться в свои корпоративные владения по ту сторону Атлантики, оставив его в изгнании от жены и детей и от места, которое он стал считать своим домом. Оценил ли он иронию своего затруднительного положения, неизвестно. Когда он наконец отвоевал у Генеральных штатов право на возвращение, Стайвесант удалился на свою ферму на острове Манхэттен и отошел от общественной жизни, чтобы тихо и респектабельно процветать вместе с Джудит и их детьми. За семнадцать лет, в течение которых он управлял огромной территорией Северной Америки в интересах своих корпоративных хозяев, он понял, что его интересы больше не связаны ни с Вест-Индской компанией, ни с Голландией. Он прожил еще четыре года в Нью-Йорке, пока не умер в 1672 году в возрасте шестидесяти лет.
По Брединскому договору, завершившему англо-голландскую войну в 1674 году, Генеральные штаты отказались от права отвоевать у Англии Новые Нидерланды в пользу возвращения Суринама (Голландской Гвианы), который недавно захватили английские войска; в то время рабы и сахарные плантации представляли для компании большую ценность. В результате сделки Голландская республика также получила мускатный остров Рун, который воки недавно отвоевали у англичан и хотели оставить себе. То, что должно было стать самым известным городом в мире, было продано за крошечный и бесплодный мускатный остров в Индонезии и несколько
