Следующее известие от Франклина должно было прибыть с Китовых островов с транспортным судном «Баррето Джуниор». Джейн немного страшилась этого письма, ведь оно должно было быть последним. Письма пришли в середине августа и были на удивление оптимистичными. На шестнадцати страницах Франклин описывал жизнь экспедиции, не скрывая от Джейн своего нетерпеливого желания начать исследования. Осмер, эконом с «Эребуса», писал своей жене, чтобы ждала его домой в 1846 году. Другие офицеры были настроены не менее оптимистично. В письме Фицджемса говорилось, что на судне с утра до вечера не умолкает смех. В его дневнике, который он отправил домой вместе с почтой, было даже сообщение про обезьянку. Так, 23 июня в 10 часов 30 минут вечера он сделал запись: «Обезьянка уже натянула на себя одеяльце, жакетку и брючки, сшитые ей матросами, поэтому можно полагать, что становится прохладно». Китовые острова встретили моряков хорошей погодой, все надеялись, что до 74-й параллели ледовые условия будут не очень сложными. Такие хорошие вести несколько успокоили Джейн. И только Крозье в письме Джемсу Кларку, Россу в диссонанс радостному хору выражал опасения, что экспедиция может попасть в район тяжелых льдов и застрять. Крозье боялся, что повторится 1824 год, когда в заливе Принс-Риджент льды раздавили судно Парри «Фьюри». Но Росс благоразумно не показал это письмо леди Франклин.
Последние письма получены, началось томительное ожидание. Кончился и 1846 год, а никаких вестей не было. Не лучшим оказался и 1847 год. С апреля по август Джейн прожила в Италии. Уже миновала вторая годовщина отплытия экспедиции Франклина. Она не знала, что в это лето, И июня, Джон Франклин скончался.
В сентябре 1847 года правительство начало готовить спасательные экспедиции в район Берингова пролива, в устье реки Макензи и к проливу Ланкастер. Джейн не удалось уговорить Адмиралтейство направить поисковую партию к устью реки Больших Рыб. Она считала, что экспедицию Франклина можно найти именно там, в районе Земли Короля Вильгельма. К сожалению, Адмиралтейство не вняло ее просьбе.
В 1848 году корабли спасательных экспедиций вышли из Англии. В январе в район Берингова пролива отправился отряд под руководством капитана Мура на судне «Плавер». Этот отряд, следуя на север кружным путем вокруг мыса Горн, должен был обследовать арктическое побережье до устья реки Макензи. Считалось, что если Франклин прошел большую часть пути и застрял где-то недалеко от Макензи, то искать его надо именно там. Пеший отряд спасателей во главе с сэром Джоном Ричардсоном и доктором Джоном Реем, вышедший в марте из Канады, должен был спуститься по реке Макензи до устья и пройти на восток до реки Коппермайн. Леди Франклин очень хотела присоединиться к отряду Ричардсона, но вынуждена была отказаться от этого плана. Последним отправлялся в мае Джемс Кларк Росс; два судна его экспедиции «Энтерпрайз» и «Инвестигейтор» должны были пройти к проливу Ланкастер.
С Россом леди Франклин писала своему пропавшему супругу: «Любовь моя, — писала Джейн, — если ты получишь это письмо, пусть облегчит оно твои страдания». Так начинала Джейн свое послание, и ей казалось, что она отправляет его на край света — так долго нужно ждать ответа и не раньше чем через год будет известно, достигло ли оно адресата.
Леди Франклин продолжала верить, что Франклина можно найти вблизи реки Больших Рыб. Она была убеждена, что Франклин, следуя данным ему инструкциям, повернул на юг или юго-запад от пролива Барроу, чтобы кратчайшим путем подойти к берегу. Джейн хорошо помнила, как однажды, еще до начала экспедиции, муж, показывая на карте западный участок пролива Симпсон, сказал, что если ему удастся туда добраться, то успех экспедиции будет обеспечен. К марту 1849 года Адмиралтейство тоже стало проявлять признаки беспокойства. Оно объявило, что любое судно, которое сможет оказать помощь пропавшей экспедиции, получит в награду 20 тысяч английских фунтов стерлингов. Однако снарядить экспедицию в тот район, куда направился Франклин, то же самое Адмиралтейство не хотело. В мае 1849 года Адмиралтейство отказалось продать леди Франклин два лихтера, которые она хотела за свой счет отправить на поиски экспедиции. Джейн мужественно приняла отказ. В июне в сопровождении верной Софи она отправилась на Оркнейские, а затем на Шетландские острова. Там она надеялась получить известие о муже от возвращавшихся из Баффинова залива китобоев. Леди Франклин предчувствовала беду, но любую правду предпочитала неизвестности. В 1849 году китобои привезли найденную у берегов Гренландии бутылку, в которой лежала записка с «Эребуса», подписанная Франклином и датированная 30 июня 1845 года. В записке указывались координаты судна, сообщалось, что на судне все в порядке. Джейн была в отчаянии — это запоздалое известие было сейчас хуже, чем неизвестность.
В ноябре в Англию с интервалом в три дня вернулись Ричардсон и Росс. Сообщения их были одинаково неутешительными.
