Кабинет министров был подобран в соответствии с личными предпочтениями и интересами президента. Единственное исключение составлял госсекретарь. На эту должность был назначен вездесущий Джеймс Блейн, который вначале был и главным политическим советником президента, хотя позже между ними возникли определенные разногласия. Блейн ушел в отставку и фактически прекратил политическую активность. Госсекретарем был назначен Джон Фостер, профессиональный дипломат, служивший ранее в Мексике, России и Испании, а теперь послушно исполнявший распоряжения Гаррисона. Все остальные семь министров были пресвитерианцами, все они служили в армии во время Гражданской войны, пятеро из них были юристами. Верный своей привычке к организованности и порядку, президент установил правило проводить два раза в неделю заседания правительства в полном составе и в определенный день недели принимать каждого министра для обсуждения вопросов, касавшихся предстоявших правительственных и президентских решений.
Со стороны министров была предпринята попытка «умилостивить» президента. По договоренности с другими министрами генеральный почтмейстер Джон Ванамейкер вместе с несколькими предпринимателями купили в подарок первой леди небольшой коттедж на мысе в штате Нью-Джерси. Вначале Гаррисон принял подарок благосклонно. Но в прессе раздались негодующие возгласы по поводу попыток «купить» министерские посты, и президент изменил свое решение. Он заставил дарителей принять чек на 10 тыс. долларов, который полностью покрывал стоимость подарка.
Во внутренней политике немалое внимание президента занимали вопросы, связанные с осуществлением реформы гражданской службы. Соответствующий закон, ликвидировавший систему вознаграждения и вводивший практику назначения на должности по конкурсу в зависимости от деловых качеств претендентов, был, как мы знаем, принят ранее, но практика реализации закона Пендлтона 1883 г. была, по мнению президента, неудовлетворительной. При его непосредственном участии продолжали разрабатываться перечни должностей и специальностей, подлежавших конкурсному замещению. В Конгрессе было немало депутатов, стремившихся возродить вознаграждение за верную службу — практику, граничившую с коррупцией. Сторонники «вознаграждения» и приверженцы конкурса были в обеих партиях, и президенту приходилось подчас идти на уступки, чтобы дело не дошло до открытого конфликта, в том числе со своими сторонниками. В прессе даже появилась карикатура, изображавшая несчастного президента, восклицающего по поводу «политического футбола»: «Что же мне делать, если каждая команда хочет первой ударить по мячу?» Гаррисон назначил в комиссию по гражданской службе активиста Республиканской партии Теодора Рузвельта, который энергично настаивал на проведении в жизнь закона Пендлтона. Но практически дело почти не сдвигалось с мертвой точки.
Еще в бытность сенатором Гаррисон выступал за расширение помощи ветеранам Гражданской войны, за распространение помощи на их семьи и введение в целом пенсий по старости как акта социального законодательства. Теперь, став президентом, он был основным инициатором внесения в Конгресс законопроекта о пенсиях иждивенцам и инвалидам, который был проведен республиканским большинством сравнительно быстро и в 1890 г. стал законом. Впервые были введены пенсии не только инвалидам, но всем участникам войны, а также, в случае смерти таковых, их родителям, вдовам и детям. По существу дела, это был новый, более широкий акт зачаточного социального законодательства, которое конгрессмены приняли с большим трудом. Получатели же пенсий закон приветствовали, авторитет президента вырос.
Правда, проведенные вскоре расчеты показали, что вводимые пенсии (расходы на них за время президентства Гаррисона составили 139 млн долларов) поглощали значительную часть приходных статей госбюджета. Вместе с другими расходами на совершенствование инфраструктуры и особенно на военно-морское строительство они приводили к быстрому росту государственного долга. Конгресс 1889–1891 гг. был прозван в прессе «Конгрессом миллиарда долларов». В этом было значительное преувеличение, но факт убыточности бюджета явно наличествовал. Если в 1890 г. пенсии получали 5,4 тыс. ветеранов, то к 1893 г. число пенсионеров выросло почти вдвое, составив 9,6 тыс. В 1894 г. на пенсии тратилось 37 % бюджета.
