Параллельно ломались структура и функции Госэнергонадзора. Указом Президента в марте 2004года он был преобразован в Федеральную службу по технологическому надзору, подведомственную всего лишь Министерству промышленности и энергетики Российской Федерации. В мае того же года к ней была присоединена ещё Федеральная служба по атомному надзору, а в июле Постановлением Правительства РФ «О Федеральной службе по экологическому, технологическому и атомному надзору», Ростехнадзор был определен как орган государственного энергетического надзора, и одновременно признано утратившим силу Постановление «О государственном энергетическом надзоре в Российской Федерации».
По непонятным причинам Постановлением Правительства РФ в мае 2008 года из Положения о Ростехнадзоре было исключено определение его как органа государственного энергетического надзора. Полномочия его в этой важнейшей области были сохранены только в сфере безопасности электрических и тепловых установок и сетей. Ликвидированы также функции: подготовки и проверки знаний энергетического персонала; рассмотрения и согласования схем развития городов и населенных пунктов; нормативно-правового регулирования в энергетике; лицензирования работ в области энергетики; контроля за рациональным и эффективным использованием ТЭР.
В настоящее время после реформ численность Ростехнадзора не превышает 1500 человек. Естественно, резко упало не только количество проверок, но и их качество, квалификационная высота вскрываемых проблем. Депутатская комиссия продемонстрировала это на примере государственного надзора за Саяно-Шушенской ГЭС, осуществляемого Саянским отделом Енисейского управления «Хакасгосэнергонадзор».
Так, в 2002году проводилась плановая проверка комплекса электроизмерительных лабораторий. На момент проверки СШГЭС располагала большим количеством электроизмерительных лабораторий, которые впоследствии были выведены за штат электростанции в соответствии с Законом о реструктуризации. Это убийственное решение, введённое Чубайсом, крайне отрицательно сказалось на обеспечении безопасности функционирования станции. А Ростехнадзор прошёл мимо этого преступления и не выдал предписание об его отмене. Да и прав на такие действия не имел. Лишь после аварии Комиссия Госдумы РФ рекомендовала Правительству вернуть в структуру Саяно-Шушенской ГЭС и других электростанций страны комплекс электроизмерительных лабораторий, что, слава Богу, было сделано.
Аналогично, без существенных замечаний, которые могли бы предотвратить надвигающуюся катастрофу, за период с 2006 по 2009 годы проведено 63 проверки по вопросам выполнения законодательства о промышленной безопасности, и даже в 2008 году – накануне техногенной катастрофы – комплексная проверка оборудования станции по плану «Русгидро», включавшая в себя экологический, промышленный, строительный и Энергонадзор, а также вопросы взрывопожаробезопасности, котлонадзора и надзора за состоянием гидротехнических сооружений.
Депутаты рекомендовали Правительству РФ для осуществления функций государственного энергетического надзора в полном объеме подготовить Указ Президента РФ об определении Ростехнадзора уполномоченным федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим государственный надзор за эффективным использованием энергетических ресурсов, и Постановление Правительства РФ «О государственном энергетическом надзоре в Российской Федерации». В них, по их мнению, необходимо рассмотреть вопрос о преобразовании действующего органа в Федеральную службу по атомному, технологическому и энергетическому надзору, то есть изъять у него функции по экологическому надзору, и консолидировать в рамках ее деятельности все задачи энергетического надзора и контроля. При этом, учитывая важность и объем возложенных задач, целесообразно закрепить его в ведении Правительства Российской Федерации. Предложено также наделить орган государственного энергетического надзора полномочиями по обобщению практики применения законодательства в области безопасности объектов энергетики, разработке предложений по его совершенствованию и внесению их в установленном порядке.