Мансабдары Моголов нанимали самые разные войска. Уникальные возможности конных лучников сделали их ядром могольской армии, но они не составляли большинства. Мансабдары обычно нанимали кадры преданных им сторонников, чьи должности часто были наследственными, набранными из их родственников или родного региона. Таким образом, мансабдары связывали имперский режим с военной силой провинций. Они дополняли свои основные контингенты местными солдатами, нанятыми из региона, в котором они находились, иногда кавалерией, но чаще всего пехотой крестьянского происхождения.
Важность мансабдаров как вербовщиков войск во многом объясняет их статус. В отличие от своих османских и сефевидских коллег, правители Великих Моголов редко казнили, понижали в должности или даже делали выговоры своим офицерам. Казнь начальника значительного количества войск лишила бы режим их службы, по крайней мере временно, и почти неизбежно привела бы к насилию. В могольских источниках говорится о назначениях и повышениях, сделанных для того, чтобы сохранить контингенты умерших мансабдаров. Хотя сыновья не наследовали звания своих отцов, они в определенной степени наследовали их последователей, и имперский режим обычно присваивал им звания, необходимые для поддержки основных контингентов.
Вопрос о том, были ли армии заминдаров частью армии Моголов, является спорным. Режим Моголов считал их таковыми; по данным Абу аль-Фазла, в армии Моголов насчитывалось 342 696 кавалерии и почти 4,4 миллиона пехоты, что составляло примерно 10 % мужского населения империи и, очевидно, включало большое количество крестьянских солдат. Если заминдары были якобы имперскими чиновниками, то их войска были якобы имперскими войсками. Поскольку заминдары фактически собирали и перечисляли большую часть налоговых поступлений, их войска действительно несли имперскую службу. Однако они не участвовали в имперских кампаниях вдали от местных баз. Почти у всех заминдаров были военные помощники; у многих были пушки, боевые слоны и небольшие крепости. Эти небольшие крестьянские армии давали заминдарам значительные рычаги влияния на местные дела, позволяя им собирать доходы, которые придавали их статусу значимость. Отсутствие имперского контроля над армиями заминдаров указывает на реальную автономию большинства заминдаров, которые были обязаны предоставлять вспомогательные силы для имперских операций в своих районах, но в остальном не поддерживали имперскую власть, за исключением той степени, в которой это было необходимо для сбора доходов.
Огромное количество потенциальных крестьянских солдат, ограниченные возможности центральной армии Моголов, ограниченный центральный контроль над контингентами мансабдаров и автономия заминдаров означали, что Моголы всегда сталкивались с возможностью восстания в провинциях. Заминдарские восстания - как правило, столкновения между заминдарами и имперскими уполномоченными из-за доходов - были не редкостью, но редко представляли собой более чем локальную проблему. На самом деле центральное правительство Моголов реагировало на эти беспорядки не из принципа, а чтобы обеспечить джагирдара его жалованьем. Однако после 1582 года восстания мансабдаров были крайне редки по нескольким причинам. У большинства мансабдаров было мало стимулов для восстания; они, как правило, были лояльны государю, чувствовали себя довольными своей участью и перспективами, и им было чего бояться. Альтернативы правлению Моголов не было. Кроме того, сеть крепостей и укрепленных городов по всей империи делала успешное восстание маловероятным. Если для армии Великих Моголов осады были сложны, то для повстанцев они были невозможны, а система крепостей, созданная Акбаром, контролировала стратегические места и маршруты по всей империи.
Шир Шах Сур фактически начал строительство сети дорог и крепостей, которое завершил Акбар. Помимо знаменитого форта Агры, Акбар построил города-крепости Лахор и Аллахабад, а также крепости Аджмер в Раджастане, Рохтас и Атток на северо-западе и еще один Рохтас в Бихаре. Крепости на северо-западе защищали границу от возможных вторжений узбеков или сефевидов; другие крепости охраняли сухопутные торговые пути и военные дороги и подавляли потенциально мятежных заминдаров. Моголы также использовали небольшие цитадели в крупных городах, особенно в провинциальных столицах. Коменданты крепостей были независимы от губернаторов провинций; мятежным губернаторам пришлось бы начинать восстание с осады цитаделей своих столиц.