Государственная повинность и налоговая система охватывали всю Россию и проникали во все ее углы и захолустья. Были обложены монастыри и церковное имущество. Произведен контроль монастырей и выявлено наличие монахов. Весь трудоспособный состав монахов был отправлен на отбывание государственных повинностей. Было запрещено поступать в монахи лицам моложе 50 лет. 16 ноября 1700 года, уже после смерти патриарха Адриана, Петр произвел систему церковного управления. Патриарший престол временно передал Стефану Яворскому, Патриарший разряд был превращен в Монастырский приказ и заведующим им был поставлен Мусин-Пушкин. Тяжелые налоги, рекрутские и трудовые наборы, грубое нарушение народных обычаев – все это создавало в народе всеобщее негодование. Народ видел в лице царя олицетворение антихриста. Тяжелая рука Петра пресекала недовольство внутри России, но на окраинах недовольство выливалось в открытые мятежи.
Пользуясь тем, что шведский король перенес войну в Польшу, Петр начал войну на Балтийском побережье в Ингрии с завоевания устьев Невы. Первым был занят Нотебург, или Орешек, 25 апреля 1703 года был занят Ниеншанц при устье реки Осты, а 16 мая тут был заложен Петербург. Потом в устье Невы был занят и укреплен остров Кроншлок. Одновременно велись военные действия в Ливонии. В 1701 году Шереметьев вступил в Ливонию и два раза нанес поражения шведским войскам. В 1704 году Шереметьев занял Дерпт, шведское войско в количестве 1388 человек сложили оружие и поступили на русскую службу, 9 августа была взята Нарва. В 1705 году началась война в Курляндии. Шереметьев столкнулся с войсками Левенгаупта и потерпел тяжелое поражение, но Левенгаупт ушел в Ригу, и русские войска заняли Митаву. Таким образом, устье Невы и Курляндия были полностью в руках царя. Но к этому времени на окраинах начались народные бунты.
Военные действия сопровождались усиленными налогами и призывом большого количества рекрутов. В стране производилась перепись населения и народного имущества. В 1705 году было приказано переписать всех торговых людей с показанием их промыслов. Всюду собирались праздные люди и отправлялись в рекрутские наряды. Под угрозой жестокого наказания ведено было собираться в Москве детям и свойственникам служилых людей и выбирать из годных для службы в драгуны и другие войска. Ежегодно с 20 дворов брали одного рекрута. В 1706 году были взяты 6000 извозчиков для пополнения полков. Из дьяков был составлен полк с собственным содержанием. Кроме рекрутских наборов, собирались рабочие люди. Для учета населения были введены метрические книги для записи крещеных, умерших и сочетавшихся браком.
Все реформы имели одну цель – усиление казны. Однако привести народ к полной покорности оказалось непросто. Забиравшиеся в рекруты и на работы разбегались, составляли разбойные шайки, производили грабежи и повсюду сеяли возмущение.
На окраинах начинались бунты. Первые восстания подняли в Поволжье башкиры и другие инородцы. Для усмирения был отправлен Шереметьев. Мятежники объявили, что царя не стало, иначе почему бы начальники стали бороды брить, немецкое платье носить и табак курить. «В церквах наших жен и детей в русском платье не допускают, а которые в церковь божию приходили, у тех платье обрезывали и от церквей божьих отлучали». К мятежу примкнули астраханские стрельцы, с восставшими должны были соединиться и мятежники Царицына. Воронежский губернатор Апраксин, узнав о поднявшемся в Астрахани мятеже, написал в Черкасск, чтобы атаман с казачками шел в Астрахань. Атаман Лукьянов собрал Круг, на котором казаки решили остаться верными царю. В Астрахань был послан отряд казаков под начальством Максима Фролова и Василия Поздеева. Казаки заняли Астрахань и разоружили стрельцов, собиравшихся идти на соединение с царицынскими. Выступление донских казаков и занятие Царицына прекратило мятежное движение, и астраханцы тоже успокоились. По усмирении мятежа в Царицыне было оставлено 900 казаков с Леонтием Поздеевым, остальные возвратились на Дон. За усмирение астраханского мятежа царь прислал казакам жалованье. С атаманом Максимом Фроловым на Дон было прислано 5 000 рублей и 2368 рублей вместо гамбургского сукна, 230 пудов пороха, 115 пудов свинца, 6500 четвертей хлеба и 500 ведер вина. Калмыкам, состоявшим на службе царя, прислано было 500 рублей да сейского железа.
1 декабря 1705 года в Москву для доклада о бунте в Астрахани прибыл атаман Ефрем Петров с 92 казаками. Царь был доволен деятельностью казаков и пожаловал их за усмирение дополнительным жалованьем. Казакам, находившимся в Царицыне в количестве 900, послано было по два рубля каждому, войску 20 000 рублей и вместе с тем пернач, бунчук, большое войсковое знамя и шесть знамен станичных. В Черкасске был заложен большой каменный собор, постройка которого была закончена в 1719 году. Таким образом, донские казаки были щедро награждены за усмирение поднятого в Астрахани мятежа.
