Долгоруковы начали расправу со своими противниками. Приверженец царевны Елизаветы, Бутурлин, был отправлен с полками на Украину. Один из Нарышкиных был сослан в отдаленную деревню. 22 ноября 1728 года скончалась великая княжна Наталья Алексеевна, 30 ноября 1729 года было совершено обручение Петра II с дочерью Алексея Долгорукова Екатериной. Регентство Долгоруковых совершенно парализовало деятельность правительства. Работа по управлению велась отдельными деятельными лицами, стоящими во главе отдельных учреждений. Для производства дел на местах был издан наказ губернаторам и воеводам, которыми они были облечены государственной властью, политической, полицейской, судебной и финансовой. На них было возложено все, что раньше выполняли земские комиссары, ландраты и ландрихты, учрежденные Петром I. В царствование Петра II была закончена экспедиция Беринга, отправленная при Екатерине I. Был окончен атлас всех губерний и уездов, заказанный Петром I. Благодаря Остерману была налажена торговля. Мерами генерала Волкова улучшена монетная система: было выпущено на три миллиона с половиной рублей медной монеты, и чеканка монеты перешла из частных рук к государству.
После восстановления выборного гетманства днепровских казаков гетману были даны инструкции, согласно которым все назначавшиеся в обозные, генеральные судьи, писаря, есаулы, бунчуковые, хорунжие и прочие чины должны были выбираться из добрых людей и имена избранных присылать в Коллегию иностранных дел. Судебные дела их разбирались в ратушах. Отсюда дела переносились в полковой суд. Апелляционной инстанцией был генеральный войсковой суд в Глухове. При гетмане состоял русский комиссар. В генеральном суде для гарантии беспристрастности должны были заседать три представителя русских и три казака. О раскольниках, находившихся среди казаков, Советом было решено, что выслать их по важным резонам невозможно и ведать ими тому, кто при гетмане состоит.
В России в царствование Петра II вооруженных сил имелось 63 полка, из них 30 конных и 33 пеших. Рекрутский набор производился из расчета 305 человек – один рекрут. С ревизского населения в 6 628 724 души взято было 16640 человек. По сведениям 1726 года в армии высшего командного состава было: полных генералов – пять, из них иностранцев – 2, генерал-майоров – 19, из них иностранцев – 8, бригадных – 22, иностранцев – 5, полковников – 115, иностранцев – 32.
В 1729 году в Прикаспийской области находилось 19 регулярных полков. Войска эти было решено усилить грузинами, армянами и черкесами. Особое внимание правительством было обращено на казаков Войска Донского. Правительство решило убедить их атаманов, чтобы они подготовили две-три тысячи казаков для добровольного переселения в район крепости Св. Креста, и Краснощеков назначался их атаманом с годовым жалованьем в 1000 рублей.
После коронации император Петр и двор находились все время в Москве. 7 января 1730 года, присутствуя на параде водоосвящения, император долгое время должен был стоять с непокрытой головой, простудился, заболел злокачественной оспой и с 18 на 19 января 1730 года скончался, имея от роду 14 лет, 8 месяцев и 13 дней. С его смертью прекращалась по мужской линии династия Романовых.
Прекращение династии Романовых, как и династии Рюриковичей, сопровождалось внутренней борьбой в среде, составлявшей окружение трона. Право престолонаследия указом Петра I было нарушено, однако нарушение это не могло продолжаться бесконечно. Назначением наследником престола Петра II при Екатерине I нарушенный порядок восстанавливался, но с его смертью снова наступало междуцарствие. Был созван Тайный совет на совещание – кому быть на престоле? Отец княжны Долгоруковой потребовал престол для дочери, состоящей в обручении с умершим императором, и даже показал письмо, якобы оставленное как завещание умершего императора. На письмо это не было обращено внимания, так же как и на предложение кандидатуры царицы-бабки Евдокии Лопухиной.
