Государыне Елизавете Петровне немедленно поступили жалобы на самоуправство и беззаконие атамана. Войсковой старшина Серебряков писал в Петербург: «Войско Донское пришло в наибеднейшее состояние и крайнее разорение от наглого нападения, неутомимого лакомства и нестерпимого насилия атамана Данилы Ефремова. Посылаемые от него старшины и прочие его люди вверх по Дону и Донцу, Медведице, Хопру, Бузулуку и по всем станицам делают великие притеснения. Станичных атаманов и казаков немилосердно бьют понапрасну и берут большие деньги, которые делят с атаманом, отчего все станицы сильно задолжали, бедные казаки принуждены юрты свои, сенокосы и прочие угодья заложить у старшин с большими процентами, и горько все плачут, не имея ниоткуда защиты. Старшины не только имение, но и законных жен у бедных казаков отнимают». Относительно пришлых людей Серебряков писал: «Почти во всех станицах беглых бурлаков умножилось до несколько тысяч, и атаман дает им паспорты».
19 марта 1766 года состоялся указ Екатерины II о размежевании земли Войска Донского от всех соседних земель. Посылке межевой комиссии предшествовала переписка между Петербургом и донским атаманом. В 1764 году императрица Екатерина потребовала от атамана Ефремова сведения: «По каким указам захватили чиновники земли, им принадлежащие? Сколько их при юртах и слободах заселенных и пустопорожних? Сколько доходу войскового и как и куда он употребляется?» У атамана Ефремова, тем же указом, отнят был незаконно захваченный юрт. У всех других старшин и казаков, незаконно владеющих землями, говорилось в указе, земли взять и употребить на пользу общую. Для межевания и съемки земель Войска Донского в 1766 году была послана межевая комиссия. В то же время на Дону была назначена комиссия для проверки экономического положения на Дону. Ответственным лицом и атаманом на Дону был сын Данилы, Степан Ефремов, ставший атаманом по указу императрицы Елизаветы, которая в 1759 году, отмечая заслуги атамана Данилы Ефремова, писала: «За многие его верные заслуги пожалован в чин генерал-майора и под командой которого, доколе он жив, должен быть его сын, войсковой атаман Степан Ефремов со всем Войском Донским…»
Таким образом власть на Дону высочайшим распоряжением превращалась в наследственную и бесконтрольную. Донские казаки к тому времени занимали все земли по рекам Дону, Сев. Донцу и их притокам – Калитве, Чиру, Медведице, Хопру, Бузулуку и другим. Станицы были почти без всяких укреплений. По всем рекам, кроме станиц, было много хуторов и селений. По описанию путешественников того времени, повсюду было множество конских табунов, скота всякого рогатого и паче овец. Земли засеяны всех видов хлебом, овощами, бахчами и огородами, разводят казаки виноград, сады и тому подобное. Соль берут на кубанской степи в расстоянии от их города Черкасска в 180 верстах в Манычском озере. В 1768 году, по войсковой росписи, служащих на Дону было 12 787 человек, из них больных – 231, под арестом – 11. В описании казаков указывается, что шаровары казаки носили широкие, но о лампасах еще не говорится. (Ригельман. «История донского казачества».)
К началу турецкой войны 9000 донских казаков находились в Польше и под начальством А. Суворова вели борьбу против конфедератов. В действующую армию против турок выступало 2000. Кроме этих частей – один полк находился в крепости Св. Димитрия и часть под начальством генерала Медема в составе калмыков, волжских и яицких казаков действовала на Кавказе, военные операции начались действиями крымских татар. 15 января 1769 года крымский хан Гирей с отрядом в 70 000 человек перешел русскую границу и вторгся в Елисаветинскую губернию с целью соединения с польскими конфедератами. Он опустошил окрестности, но от крепости был отбит крепостной артиллерией, и это был последний набег крымских татар на русскую землю.
Русская армия под начальством кн. Голицына 15 апреля перешла Днестр в направлении к Хотину. Но ввиду того, что Молдавия была опустошена татарами и отсутствовала артиллерия, Голицын не решился осаждать Хотин и отвел армию за Днестр. Но ему приказано было снова начать активные действия и перейти Днестр. Он переправился и обложил Хотин. Но на помощь осажденным туркам подошли и подкрепления со стороны Крыма, и на военном совете было решено отвести армию за Днестр. Турецкие части последовали за русскими, но в нескольких боях потерпели поражения. Русские переправились через Днестр и заняли Хотин. В сентябре Голицын был смещен и на его место назначен Румянцев. Русскими войсками был занят город Яссы, и население было приведено к присяге русской императрице.