В 1368 году Чжу Юаньчжан провозгласил себя императором династии Мин в Нанкине. Затем он предпринял поход на север и выслал императора Юань Шунди из Пекина. Два года спустя армия Мин захватила Таочжоу, Миньчжоу и Хэчжоу, где располагался Верховный комиссар по общественному порядку У-Цанга. В это же время другое подразделение армии Мин заняло Инчан, где нашел пристанище император Юань Шунди. Через два года последний император Юань умер от болезни в Мобэйе. В 1370 году Верховный комиссар по общественному порядку Тубо Хэ Сонам сдался династии Мин. Чжу Юаньчжан (император Хунву) направил послов с предложением амнистии для местных религиозных и политических лидеров. Намгьел Палзангпо, лидер Сакьяпа и бывший императорский наставник, сдался в 1372 году. Он привел в Нанкин больше 60 человек, чтобы представить их императору Хунву. Намгьелу Палзангпо был присвоен титул Будды Теджапрабхи и государственного наставника. Больше ста бывших чиновников империи Юань, представленных ко двору династии Мин, получили награды. Шакья Гьялцен, племянник бывшего Тай Ситу Чанчуба Гьялцена, был в то время дези (регентом) режима Пхагдру. Императорский двор династии Юань присвоил ему титул государственного советника по посвящению в тантризм. Император Хунву вернул ему тот же титул, а также пожаловал нефритовую печать и яркие атласные ткани. В январе 1373 года Шакья Гьялцен отправил послов к императорскому двору династии Мин с подарками: статуями Будды, священными письменами и шарирами (кристаллическими образованиями после кремации Будды).
Позднее император Хунву внес некоторые изменения в устройство административных органов Тибета. В июле 1374 года в Хэчжоу была сформирована Сианьская региональная военная комиссия для управления Хэчжоу, Мдо Хамсом и У-Цангом. Губернатор Хэчжоу Вэй Чжэн был назначен главой канцелярии. Гарнизоны в Мдо Хамсе и У-Цанге позднее были преобразованы в региональные военные комиссии. В декабре 1374 года субпрефект региональной военной комиссии Мдо Хамс Намгьел Палзангпо и Сонам Одсер направили послов к императорскому двору Мин, рекомендуя 56 человек, в числе которых был Джанчуб Гьялцен, на посты правительственных чиновников. Император Хунву учредил Управление верховного комиссара по сохранению общественного порядка Мдо Хамса, шесть управлений комиссара экспедиционной службы, четыре мириархии, семнадцать хилиархий, назначив рекомендованных лиц на должности субпрефекта, Верховного комиссара по сохранению общественного порядка, Комиссара экспедиционной службы, хилиарха (главы поселения с населением в тысячу человек) и мириарха (главы поселения с населением 10 тыс. человек). Советник провинции Шэньси Сюй Юньдэ прибыл в Тибет с императорскими указами и печатями, чтобы объявить об этих назначениях.
После создания административной системы, включающей региональные военные комиссии, гарнизоны и охранные посты в населенных тибетцами районах, династия Мин поставила во главе этих учреждений многих тибетских лидеров. Указы о назначениях можно увидеть среди документов династии Мин и в ряде исторических документов на тибетском языке. Например, в книге «Подлинная летопись Мин Тайцзу (императора Хунву)» указывалось, что «Гьялцен Палзангпо, субпрефект региональной военной комиссии У-Цанга, Верховный комиссар по сохранению общественного порядка Дорджи Иринцин, бывший маршал Сонам Зангпо, бывший Ситу Лотро Гьялцен, командир гарнизона Рудруб Зангпо и монах Кармапа от мириарха Кунгапы платили щедрую дань императорскому двору Мин» в феврале 1379 года.
Лотро Гьялцен из семьи Такцанг Дзонгпа в Намлинге был третьим сыном Сакья Пончен Гьелва Зангпо, он построил большой замок во время своего правления в Намлинге. Кунгапа из правящей семьи Ямдрок (древнее название Гьянгзе) в верховьях реки Ньянгчу был отцом строителя монастыря Пелкор Чоде Рабтена Кунзанг Пхака. Поскольку в династии Юань не было такой мириархии, его происхождение из рода Ямдрок предполагало определенные привилегии, даруемые династией Мин.
В источнике «Подлинная летопись Мин Тайцзу» также говорится, что Палджор Зангпо был назначен региональным военным комиссаром У-Цанга в январе 1385 года. Чиновник из семьи Цальпа был внуком автора «Красных анналов» Кунги Дордже. В январе Гуру Гьялцен, начальник гарнизона Ямдрок, был назначен помощником командующего У-Цангской региональной военной комиссией. Оба занимали государственные должности третьего класса. Наследственные должности, присуждаемые императорским двором династии Мин в населенных тибетцами районах, включали военного комиссара, помощника военного комиссара, хилиарха и центуриона. Однако наследование важных государственных должностей необходимо было подтвердить соответствующими указами, заверенными печатями императоров династии Мин.
