Отраслевые министры, с которыми у Кузнецова всегда было много спорных вопросов, теперь вовсе могли его игнорировать и обращаться непосредственно к министру обороны. Особенно бесило Кузнецова (и справедливо!), когда важные вопросы тормозились в аппарате минобороны. Вспоминая худшие времена, он, подписав очередной доклад министру, вынужден был ждать ответа от какого-нибудь референта — полковника или капитана 1-го ранга. Причем именно на основании мнения этих референтов и решалась судьба его доклада!
Впрочем, новая эпоха принесла и добрые перемены, например пересмотр старых судебных дел. Постановлением Пленума Верховного Суда СССР был отменен приговор Верховной коллегии от 3 февраля 1948 года в отношении Галлера, Алафузова и вице-адмирала Степанова «за отсутствием состава уголовного преступления». Буквально через два дня Кузнецов запросил Верховный Суд СССР о судьбе адмирала Л. М. Галлера, на что получил ответ председателя Военной коллегии Верховного Суда СССР генерал-лейтенанта юстиции А. Чепцова: «Сообщаю, что по извещению МВД СССР Галлер Лев Михайлович, 1883 года рождения, умер 12 июля 1950 г. в Казани». Увы, старый адмирал реабилитации не дождался. Что касается Алафузова, ему вернули звание адмирала. Своего старого друга Кузнецов назначил заместителем начальника Военно-морской академии. Степанову вернули звание вице-адмирала, после чего Кузнецов пристроил ветерана членом редколлегии и главным редактором 3-го военно-исторического тома Морского атласа. Учитывая заслуги адмиралов, а также допущенную к ним несправедливость, флотская общественность отнеслась к этим назначениям с пониманием.
Следует сказать, что в этот период Кузнецов приложил немало сил, чтобы возродить флотские традиции, воздав должное ветеранам императорского флота. Так, по его приказу по всей стране искали моряков с легендарного крейсера «Варяг», принявшего неравный бой с японской эскадрой в корейском порту Чемульпо в 1904 году. Найденных матросов пригласили в Москву 9 февраля 1954 года, в 50-летнюю годовщину героического боя крейсера с японской эскадрой. Кузнецов выступил с речью на вечере, где 15 ветеранов были награждены медалью «За отвагу». По приказу Кузнецова ветеранов «Варяга» возили по военно-морским училищам, где они выступали перед будущими офицерами ВМФ СССР. И не только выступали! Один из ветеранов ВМФ рассказывал автору книги, что когда к ним в училище привезли старого матроса с легендарного крейсера «Варяг», то всех курсантов (а это больше тысячи человек) выстроили друг за другом и они по очереди жали ветерану руку. Разумеется, делали это деликатно, так как выдержать тысячу рукопожатий и здоровому человеку нелегко. По воспоминаниям ветерана, за всю его более чем 40-летнюю службу в ВМФ ничего не произвело на него такого огромного впечатления, как рукопожатие героя крейсера «Варяг». В данном рукопожатии был особый смысл. Фактически было осуществлено некое сакральное посвящение (рукоположение!) целого поколения будущих советских офицеров ВМФ в ряды героев. Согласитесь, чтобы организовать все это в советское время, надо было иметь и мужество, и волю.
Кроме «варяжцев» по приказу Кузнецова отыскали и бывшего старшину эсминца «Гром» Ф. Е. Самончука, который в бою с германскими кораблями в Моонзундском проливе в октябре 1917 года последней торпедой потопил немецкий эсминец, а потом взорвал свой поврежденный корабль, чтобы тот не достался врагу. По ходатайству Кузнецова, всеми забытого Самончука наградили орденом Боевого Красного Знамени и определили персональную пенсию. В 1955 году Кузнецов также разыщет и наградит орденами Боевого Красного Знамени ветеранов мятежного броненосца «Потемкин».
Помимо этого, по приказу Кузнецова на флотах и в приморских городах были приведены в порядок и восстановлены разрушенные могилы многих деятелей дореволюционного российского флота. В этом Кузнецов видел долг памяти героям предшествующих поколений и огромное воспитательное значение для молодых моряков.
В мае 1954 года Кузнецов посетил Ленинград и Кронштадт, где выступил с докладом в Доме офицеров флота на торжественном собрании, посвященном 250-летию со дня основания Кронштадтской военно-морской крепости, а затем участвовал в военно-морском параде.