В губисполкоме большинство имели левые эсеры и максималисты. Борьба между большевистским горсоветом, опиравшимся на революционных рабочих, и эсеровским губисполкомом к середине мая достигла наивысшего предела. 17 мая 1918 года произошло вооруженное контрреволюционное выступление анархо-максималистов, которое удалось ликвидировать силами коммунистической дружины. Формально губисполком отмежевался от мятежников, но фактически мятеж был вызван демагогией губисполкома и левых эсеров.
В городе имелась подпольная белогвардейская офицерская организация, связанная с эсерами.
Эта офицерская банда всячески старалась дезорганизовать тыл красных.
В таких невероятно тяжелых условиях самарским большевикам приходилось организовывать защиту Самары.
К непосредственной организации обороны Самары большевики приступили 29 мая, когда было получено сообщение о выступлении чехо-словаков в Пензе. В этот же день Самара была объявлена на осадном положении, а на следующий день для руководства обороной был создан боевой революционный штаб в составе В. В. Куйбышева, Гузакова и М. С. Кадомцева.
Штаб опубликовал призыв к профсоюзам о мобилизации рабочих для защиты Самары.
Наряду с этим общегородское собрание членов РКП(б) объявило мобилизованными всех членов партии, способных носить оружие.
На призыв штаба о записи добровольцев в боевую дружину рабочие откликнулись очень дружно. За 3–4 дня дружина с 400 человек увеличилась примерно до 2 тысяч. Профсоюзы металлистов, кожевников организовали специальные отряды, которые и были переданы в распоряжение штаба.
Но если рабочие отряды организовать было сравнительно не трудно, то гораздо труднее было подыскать соответствующих специалистов, оборудование, боеприпасы и пр. У всех, кто вступил в боевые дружины, было горячее желание биться с врагом до последней капли крови.
К сожалению, боевая подготовка отрядов была очень низка. Еще хуже обстояло дело с военными специалистами. Среди большевиков таких специалистов почти не было, за исключением одиночек.
Когда т. Подвойский, бывший в то время в Самаре, потребовал от штаба ПРИВО дать людей для организации обороны Самары, собрание офицеров штаба отказало, мотивируя тем, что они поступили на службу в штаб с условием не участвовать в гражданской войне. Только после долгих переговоров и угроз штабисты выделили из своей среды трех военспецов.
Можно себе представить, что за помощь получили большевики от этих военспецов, с нетерпением ожидавших прихода чехо-словаков!
Первое вооруженное столкновение самарских отрядов с чехо-словаками произошло у Сызранского моста через Волгу. Туда был послан латышский отряд в 100 человек. Но эта горсточка людей не в силах была оказать серьезное сопротивление нескольким тысячам хорошо вооруженных чехословацких войск и была отброшена. После боев у Майтуги и Безенчука советские отряды отступили к Русским Липягам, где стали готовиться к решительному сражению.
Советских войск под Липягами было около 2500 человек. Их слабость заключалась в том, что по своему составу они не представляли единого целого: тут были дружины коммунистов и левых эсеров, отряды рабочих, уфимские отряды, составленные из недавно мобилизованных татаро-башкирских рот. Все отряды в целом были плохо обучены военному делу, не имели знающего военное дело командного состава.
Имея подробные сведения о расположении и численности советских войск, чехо-словаки с утра 4 июня повели наступление на Липяги. Взяв красных в кольцо с трех сторон, чехо-словаки открыли перекрестный огонь. Советские отряды не выдержали натиска во много раз сильнейшего и лучше вооруженного противника и отступили к Самаре.
Потери советских отрядов были очень значительные. Из 2500 человек в Самару вернулось около тысячи, более 200 человек попало в плен к чехо-словакам, остальные погибли, причем несколько сот человек утонуло в разлившейся реке Татьянке при попытке переправиться через нее вплавь.
В этом сражении много безвестных товарищей проявили себя как истинные герои. Геройски погиб почти целиком латышский стрелковый полк, окруженный и прижатый чехо-словаками к реке. Расстреляв последние патроны и не желая живыми сдаваться в плен, многие товарищи из оставшихся в живых последнюю пулю пускали в себя. Сам командир советских войск т. Кадомцев вместе с небольшим отрядом кавалерии пытался пробиться через огонь чехо-словаков, но был убит вместе со своими бойцами.
Одержав победу под Липягами, чехо-словаки однако не продвигались дальше в течение трех дней. С тыла их настигли красные отряды, подошедшие из Пензы и Ульяновска. Хотя сражение с этими отрядами также кончилось победой чехо-словаков, все же они были вынуждены отложить продвижение на Самару.