По-прежнему знания в области зоологии преимущественно основывались на Плинии и бестиариях. Более «научные» способы лечения стали известны лишь в XIII веке с переводами Михаила Скота аристотелевских сочинений о животных и их сокращенной арабской версии Авиценны. Обычные животные становятся предметом пристального изучения, и короли стали заводить зверинцы с наиболее редкими и диковинными зверями. Хотя в распоряжении первых нормандских государей имелись собственные леса (разве Вильгельм Завоеватель не «любил высоких оленей отеческой любовью»?), при Анжуйцах в Англию были привезены леопарды, а Генрих II получил в подарок верблюдов от сарацинского государя Валенсии. Вслед за своими современниками-мусульманами Фридрих II создал большой зверинец, который он возил с собой по Италии и даже привез в Германию. В 1231 году он прибыл в Равенну «со множеством невиданных в Италии животных: со слонами, одногорбыми и двугорбыми верблюдами, пантерами, кречетами, львами, леопардами, белыми соколами и бородатыми совками». Пять лет спустя подобная процессия прошла через Парму на радость пятнадцатилетнему мальчику, который в будущем станет известным как Салимбене. Подаренный султаном слон был оставлен в гибеллинской Кремоне, где он был предоставлен в распоряжение графу Корнуоллу и умер тринадцать лет спустя «от избытка гуморов», в атмосфере всеобщего ожидания того, чтобы пустить его останки на изделия из слоновой кости. В 1245 году монахи аббатства Святого Зенона в Вероне, оказывая гостеприимство императору, устроили ему прием, на котором присутствовали слон, пять леопардов и двадцать четыре верблюда. Верблюдов использовали для перевозок, и порой, к изумлению не бывавших в дальних краях немцев, их вместе с обезьянами и леопардами привозили и за ту сторону Альп. Еще одной жемчужиной коллекции был первый в средневековой Европе жираф, подаренный султаном. Широкое распространение получают изображения на изделиях из слоновой кости обезьян и павлинов с Востока, столь же древние, как Ниневия и Тир, и столь же современные, как нынешний зоопарк. В XIII веке Матвей Парижский посчитал слона слишком редким животными, чтобы не изобразить его на страницах своей «Истории», а Виллар де Оннекур, увидев льва во время путешествия, в своем альбоме для зарисовок аккуратно отметил: «Срисовано с натуры!» Наблюдения Виллара не ограничивались подобными исключительными случаями, о чем свидетельствуют другие его наброски, начиная с изображений лебедей и попугаев и заканчивая улитками и кузнечиками.
Развитие ботаники в XII веке в основном связано с врачеванием (
До нас не дошли трактаты XII века о сельском хозяйстве, а такие сочинения, как «Земледелие» Уолтера из Хенли и «О выгодах сельского хозяйства» Петра Кресценция, были написаны лишь век спустя. Влияние латинских классиков ограничивается несколькими сохранившимися списками сочинений Варрона, Палладия и Колумеллы, пизанец Бургундио перевел фрагмент о виноградарстве из греческой «Геопоники», однако сельское хозяйство в течение многих веков по-прежнему оставалось областью сугубо практической. В этот период основанное на римских традициях земледелие, проникнув на Север, сумело распространиться на востоке Германии за счет монастырской колонизации и обогатиться новыми сельскохозяйственными культурами, которые попали на Запад из Средиземноморья в результате Крестовых походов. Но все это не носило научного характера. Сельскохозяйственная опытная станция появится еще нескоро.
