Экологические беды, особенно поднятые в атмосферу планеты выбросы вулканов, зловещими символами которых стали периодические затемнения Солнца, вызвали похолодание, что не могло не отразиться на жизни и хозяйстве ромеев. Эпидемии, занесенные с Ближнего Востока, от различных варваров, с которыми пришлось тесно столкнуться в годы войн, свирепствовали внутри страны. Проникнув через порт Клисму на Красном море, а возможно, и через город Пелусий, уже с 541 г. началась пандемия — циклически возвращающаяся эпидемия страшной чумы, которая смертоносным валом пронеслась по землям Ромейского царства, чтобы потом возвращаться вновь и вновь. Исключительно заразная и исключительно смертоносная бацилла Йерсена, палочка, вызывающая бубонную чуму, будет открыта лишь в конце XIX в. А тогда, в кошмарное лето 542 г., даже укусы вездесущих блох, переносивших палочку Yersinia pestis, гарантировал инфекцию. Если она поражала легкие, возникали болезненные опухоли у лимфоузлов, и смерть наступала в течение недели; если она попадала в кровь, по всему телу появлялись черные пятна, и жертве оставалось жить не больше дня. По рассказам очевидцев, в Константинополе, особенно жестоко пораженном болезнью, не хватало живых, дабы ежедневно хоронить новые и новые тысячи умерших. Почерневшие трупы, изуродованные гнойными бубонами и папулами, валялись на улицах, и поднимавшаяся от них жуткая вонь отравляла живых. Дома, корабли с их экипажами, почтовые станции на дорогах превращались в могилы. Везде можно было видеть брошенный, дичавший скот и неубранные поля. Среди заболевших оказался сам император Юстиниан I, чудом выживший. Мертвецов, число которых стремительно росло, на повозках вывозили в поля, виноградники, сады, пустующие цистерны для воды, ими доверху наполняли крепостные башни, которые превратились в гигантские могильные ямы.
В 558 г. «Юстинианова» чума вспыхнула с новой силой и периодически, около восемнадцати раз возобновлялась до середины VIII в. в интервалах от десяти до 24 лет. В итоге, уже к 600 г. инфекционные болезни унесли жизни почти 40 % (около 12 миллионов) всех жителей Ромейского царства, изменив само видение мира и общества. Демографический спад помог избежать продовольственного кризиса в стране, но особенно остро сказался на численности горожан, армии и, хотя в целом слабо затронул экономику, снизил поступление налогов.
Испепелив немалые силы в разожженном ею же костре «отвоевательных» войн, Византийская империя, как и следовало ожидать, не смогла удержать всех захваченных земель. Рост недовольства во всех слоях населения, как следствие, привел к снижению потенциальной мощи и обороноспособности страны. Ее удаленные от Константинополя
Еще короче оказалось ромейское присутствие на испанских землях. Западные готы, перейдя в контрнаступление, постепенно, в течение пятидесяти лет, к 625 г. отвоевывают стратегически важные владения Византийской империи на юго-востоке Пиренейского полуострова, в том числе важнейший опорный пункт ромеев — Картахену (ныне Кордову) — столицу византийской Испании, дважды переходившую из рук в руки. Это была очередная из крупных потерь Ромейского царства.