Великая Отечественная война застала Ф. И. Шинкаренко в военно-воздушной академии. Вскоре, получив под свое командование истребительный авиационный полк, он убыл на фронт. Летчики полка прикрывали Орел, Брянск, Тулу от ударов «юнкерсов» и «хейнкелей», сбивали «мессершмиттов» и «фокке-вульфов» над Украиной, Белоруссией, Прибалтикой.
Трудными, тяжелыми были те бои. Не с «эрзац-летчиками», а с отборными асами приходилось сражаться не на жизнь, а на смерть. К тому же на стороне фашистской авиации все еще оставалось количественное превосходство в воздухе. Сколько напряженного труда, силы, воли, мастерства требовалось от авиаторов, чтобы лишить ее этого преимущества! Достижение победы над коварным и сильным врагом осложнялось еще и тем, что в полку было больше половины летчиков-сержантов, недавно окончивших авиационные школы и училища. Они имели лишь по нескольку часов налета, причем на самолетах устаревших марок, не умели стрелять в воздухе, держаться в боевых порядках.
«Учить, учить, ставить на крыло!» — требовал от командиров эскадрилий командир полка Ф. И. Шинкаренко. И сам изыскивал наиболее доступные, высокорезультативные формы и методы обучения и ввода молодых летчиков в бой. В газете «Сталинский сокол» было опубликовано его письмо, которое молодые летчики хранили в своих планшетах. Вот что говорилось в этом письме:
