Но не политика была первоочередным занятием папы. Он хотел переделать Церковь под единственно достойную модель – Христа. Это намерение демонстрировала его пасхальная речь в 1215г. на открытии IV Лютеранского собора. – Для выполнения своей миссии Церковь нуждается в свободе, утверждал Иннокентий. Недопустимо, чтобы Рим подчинялся империи; Церкви необходимы простор и гарантия независимости. В конечном счете, светская власть при некоторой автономии в своих владениях, не должна самоуправно пользоваться ею. Ведь она получает свою миссию от папы, который имеет право проверять, достойна ли она этой передачи полномочий. Личность Иннокентия II была гораздо значительнее обоих принцев, оспаривавших корону. С трудом установленное Фридрихом I Барбароссой равновесие между империей и папством, было нарушено.
Иннокентий III заявил в 1198г., что ему полагается разрешить соперничество между Филиппом и Оттоном. Духовные и светские князья безуспешно пытались протестовать против вмешательства папы в дела империи. В 1200 году был оглашен документ «Решение проблемы империи». Он высказался в пользу Оттона, уступившего императорские права в Центральной Италии и признавшего сюзеренитет папского престола над нормандским государством. Размышления Иннокентия III, дополненные в 1202г. декреталией
Однако поддержка папы не обеспечила победу партии Вельфов. У Оттона было больше приверженцев за пределами государства, чем внутри Германии, и Филиппу удалось пройти повторное избрание и коронацию в Ахене; даже Кельн оставил Оттона в 1206г. Подчинившись реальности, папа Иннокентий III повернулся в сторону победителя. В мае 1208г. переговоры привели к компромиссу, обязавшему обе стороны к тяжелым, но сносным уступкам. Папа согласился признать Филиппа, но в это время события разрушили надежды на разрешение конфликта. По личным мотивам Баварский пфальцграф убил Филиппа в Бамберге 21 июня 1208г, и 4 ноября следующего года папа короновал Оттона IV в Риме. Теперь и министериалы перешли в другой лагерь. Оттон взял в жены невесту своего соперника, и эта свадьба сделала из него в некотором роде Штауфена. Сразу после коронации Оттон последовал политике своих предшественников, Фридриха и Генриха. Следуя призывам немцев в Сицилии, он в ноябре 2010г. отправился в путь с намерением восстановить то, что папе с трудом удалось развалить. Реакция Иннокентия III последовала быстро. Не выполнивший своих обязательств Оттон был отлучен от церкви. Позже, следуя советам, приходящим из Франции, папа побудил противников Оттона IV избрать молодого короля Сицилии Фридриха-Рожера, чьим наставником он был. Это произошло летом 1211г.
Фридрих II,
Фридрих-Рожер /Фридрих II/, поколебавшись, отправился в дорогу. - В Сицилии его власть была неустойчива, что же происходит в другом месте? По дороге в Рим он получил поощрение папы, но в Ломбардии ему с трудом удалось ускользнуть от миланцев. Как встретят немцы нового «короля священников», исполнителя папской политики? Легат заставил город принять Фридриха-Рожера в то время, когда Констанция готовилась к встрече с Оттоном IV. Это свидетельствовало об изменении ситуации. «Дитя Апулии», увенчанный славой имени Гогенштауфенов, вытеснил Оттона из его Кельнского бастиона. Оттон переправился через Ла-Манш и до своей смерти в 1218г. оставался врагом, которого следовало остерегаться.
