После взятия власти Моссовету и его ВРК пришлось сразу столкнуться с массовым саботажем со стороны служащих. Поскольку городская дума была распущена, а новые выборы назначены на 26 ноября, управление оказалось в руках районных дум. С большим трудом удалось пустить трамваи, необходимо было наладить электроснабжение, работу водопровода, городских учреждений. ВРК назначил 5 комиссаров и с помощью профсоюза 7 ноября удалось решить вопрос о выплате жалования из Госбанка городским рабочим и милиционерам, хотя все учреждения самоуправления, банковские и хозяйственные были разгромлены, со всех сторон надвигалась опасность саботажа и бойкота. Большевики могли рассчитывать только на собственные силы и средства и должны были показать всем и всякому, что у них силы имеются, что они эту работу могут вынести на своих плечах.
10 ноября состоялись похороны жертв октябрьских боев в Москве…
14 ноября 1917 года был избран единый исполком Моссовета рабочих и солдатских депутатов. В него вошли 90 человек, в том числе 63 большевика. Председателем президиума был избран большевик М.Н. Покровский. П.Г. Смидович вошел в состав президиума.
П.Г. Смидович досконально знал политическую и экономическую ситуацию в Москве, расстановку сил и возможности депутатского корпуса Моссовета. Принятая по его докладу Моссовету 25 ноября (8 декабря) 1917 года инструкция экономического отдела Моссовета по рабочему контролю направляла энергию специально созданных комиссий на организацию учета рабочей силы, материалов, оборудования, наведение элементарного порядка на предприятиях. В отличие от декрета СНК в инструкции предусматривалось положение о финансовом контроле, о необходимости связи между контролем над производством и распределением, что отражало, очевидно, нежелание руководства города формировать «красногвардейскую атаку на капитал» и разрушать прежние механизмы до основания.
11 марта 1918 года в Москву переехали советское правительство и ВЦИК. Организация размещения СНК и ВЦИК была поручена П.Г. Смидовичу и гражданскому комиссару Кремля П.П. Малиновскому. Ответственная работа была проведена организованно. Уже на следующий день, 12 марта 1918 года, Моссовет принимал главу правительства. На заседании обсуждался продовольственный вопрос. Сам Моссовет в это время был для руководства страны олицетворением власти трудящихся, трибуной для обсуждения важнейших проблем внутренней и внешней политики. Здесь постоянно выступали лидеры партии и государства, международные деятели.
По итогам выборов в Моссовет в апреле 1918 года прошли 605 большевиков. 42 из 60 членов Исполкома были членами РСДРП(б). В целом, большевики имели 67 % мест в Совете, левые эсеры — 5 %, меньшевики — 11,5 %. Было избрано также 45 беспартийных. Председателем Президиума Совета стал П.Г. Смидович. В противовес выдвинутой большевиками кандидатуре П.Г. Смидовича, ни одна фракция не смогла найти подходящих альтернатив. Он был избран значительным большинством голосов, что свидетельствовало о его высоком и устойчивом авторитете. В руководящие органы вошли большевики А.А. Алешин, М.Ф. Владимирский, В.А.Обух, М.И. Рогов, Н.А. Семашко, А.М. Цихон и другие.
Смидовичу предстояло наладить продуктивную работу органов управления столицы и способствовать согласованной деятельности фракций. Однако это было непросто. Меньшевики и правые эсеры резко протестовали против практически всех предложений большевиков и поддерживающих их левых эсеров. Все заседания сопровождались криками, протестами, выступавшие прерывались шумом и аплодисментами с обеих сторон. Меньшевики обвиняли П.Г. Смидовича как председателя Президиума в нарушении регламента и прав членов Совета. Однако он, призывая депутатов к спокойствию и уважению воли большинства, последовательно добивался перевода обсуждения в конструктивное русло, предоставляя возможность высказаться всем фракциям.
Конфликт вспыхивал по каждому вопросу. Столичная модель должна была служить образцом для рождавшегося в ходе грандиозного социального эксперимента нового механизма власти, олицетворять подлинное народовластие, обеспечивать жизнедеятельность сложного организма в чрезвычайных условиях гражданской войны.
П.Г. Смидович стал одним из непосредственных создателей этой модели. 19 апреля 1918 года исполком Моссовета определил численный состав руководящих органов, избираемых на пленарном заседании (Исполком — 60 человек, Президиум — 25 человек). Они должны были осуществлять управление столицей через соответствующие отделы, а депутаты — контроль и учет работы советских учреждений через возглавляемые членами Президиума контрольные ревизионные и другие временные и постоянные комиссии. В составе Моссовета было создано 17 отделов, обеспечивающих организацию всех сторон жизни города и губернии.