Четыре года спустя скончался и регент Джедрунг Ринпоче. По рекомендации местных лам Центральное правительство Цин назначило регентом Нгаванга Лобсанга Тринли Рабгье, Демо Ринпоче VIII. В 1888 году Панчен-лама IX был идентифицирован и принял правление. Демо Ринпоче ушел с поста регента в 1894 году, предоставив 19-летнему Далай-ламе XIII самому заниматься тибетскими делами. Однако в 1899 году между ними вспыхнули конфликты. Демо Ринпоче и его сподвижники были арестованы после обвинения в черной магии и организации покушения на Далай-ламу. Бывший регент умер в тюрьме. Его поместья и храмы были конфискованы. Поиски его реинкарнации были запрещены.
Тибет был оккупирован Англией в 1840–1911 годах. Сама оккупация осуществлялась в несколько этапов.
Западная миссионерская деятельность в Тибете началась в конце правления династии Мин. Португальские священники построили католическую церковь в Гуге Нгари в 1624 году. Португальская миссионерская деятельность также была зафиксирована в Шигадзе три года спустя. В 1715 году итальянский иезуитский священник Ипполито Дезидери проводил миссионерскую работу в Лхасе. В 1745 году все священники-капуцины были депортированы из Лхасы династией Цин. Однако, несмотря на главную цель их миссий, а именно проповедование христианства, эти священники также изучали местные природные и социальные условия и подготавливали почву для расширения присутствия их стран.
