Однако после тщательного рассмотрения проекта договора Министерство иностранных дел Цин дало Ютаю указание не подписывать его. Амбань озвучил позицию Китая: все связанные с Тибетом условия должны быть обсуждены с Центральным правительством, а компенсация должна быть согласована, а не назначена. Россия и Франция также выступили против Лхасского договора. Поскольку Тибет являлся частью китайской территории, международные договоры, касающиеся его, превращались в незаконные и недействительные без одобрения Центрального правительства Цин. Когда 23 сентября британские войска вышли из Лхасы, полковник Янгхазбенд предложил амбаню Ютаю подписать договор. Однако Ютай отказался. В конце 1904 года новый британский кабинет согласился пересмотреть договор. В январе 1905 года вице-министр иностранных дел Тан Шаойя и советник Чжан Иньтан были направлены для переговоров с британскими посланниками в Калькутту. Джордж Керзон, хотя и ушел в отставку с поста вице-короля Британской Индии, манипулировал британскими представителями, чтобы продвинуть идею «сюзеренитета» Китая над Тибетом. Против такой формулировки решительно выступили два китайских представителя, и переговоры зашли в тупик. Воспользовавшись конфликтами между тибетскими правителями и Центральным правительством Цин, Британия попыталась создать марионеточное местное правительство в Тибете. Однако Чжан Иньтаню удалось убедить Панчен-ламу IX не преклонять колени перед британским принцем во время встречи и не давать согласия. Китай и Великобритания возобновили переговоры в Пекине в 1906 году. 27 апреля они подписали китайско-британский договор, во втором пункте которого говорилось, что «Соединенное Королевство соглашается не оккупировать Тибет и не вмешиваться в местную политику, а Китай обещает препятствовать другим странам сделать то же самое». К документу прилагался Лхасский договор, подписанный в 1904 году. Новый договор ясно давал понять, что Китай обладает властью над Тибетом и несет ответственность за предотвращение иностранного вмешательства. Всеми внешними делами, касающимися Тибета, должно было заниматься Центральное правительство династии Цин. В августе 1907 года Великобритания и Россия подписали Конвенцию по делам Персии, Афганистана и Тибета. Это означало, что их «особый интерес» к Тибету сохранился. Обе страны обещали «взаимодействовать с Тибетом только через Центральное правительство Цин» и рассматривали Тибет в качестве буферной зоны между сферами их влияния. Однако Великобритания убедила Россию вписать в соглашение сюзеренитет Китая над Тибетом. Такая формулировка указывала на то, что Британия активно готовилась к новому вторжению.
Две развязанных Британией войны вызвали жесткую критику амбаней и Центрального правительства Цин, проводивших миролюбивую политику. Центральное правительство Цин осознало риск, связанный с возрастающим интересом к Тибету, и важность укрепления его юго-западных границ. В апреле 1906 года Чжан Иньтан занял пост вице-амбаня и стал первым и единственным ханьским китайским амбанем в истории династии Цин. Он отстранил от дел десяток чиновников, в том числе амбаня Ютая, обвинив их в коррупции и халатности во время сопротивления британской агрессии. Позднее Центральное правительство Цин отстранило Ютая от должности амбаня, калон Пунког Вангдан был также уволен. Такие антикоррупционные меры вдохновили тибетский народ и снискали общественное одобрение. Учитывая внешнюю угрозу и обнищание народа, Чжан Иньтан решил реформировать политическую и экономическую системы, а также обучить и усилить армию. В январе 1907 года он предложил Министерству иностранных дел династии Цин принять 24 новых меры, которые были полностью одобрены.
Вице-амбань приказал правительству Кашаг создать девять организаций: переговорную службу, патрульную полицию, армейский надзор (отвечающий за подготовку армии), отдел соли и чая (отвечающий за чайные плантации, сбор транспортного и солевого налога), финансовый отдел (создание банков и выпуск новых монет), торговую палату, управление дорог и горнодобывающей промышленности, департамент образования (общедоступные школы) и сельского хозяйства (мелиорация земель и улучшение пород скота). Чжань написал две брошюры: «Краткое введение в военную подготовку» и «Реформа тибетских обычаев», а затем распространил их тибетскую версию. Он ездил в монастырь Джокханг, чтобы рассказать монахам и мирянам об истинных целях британской агрессии и важности проводимых реформ. Эти реформистские меры, однако, вызвали подозрение у преемника амбаня – Ляньюя. Центральное правительство Цин также сочло реформы Чжана чересчур радикальными. Поэтому в мае 1907 года его отправили в индийскую Шимлу для переговоров с Великобританией относительно открытия Гяндзе. Тем временем Ляньюй (после утверждения его назначения Центральным правительством Цин) упразднил должность вице-амбаня. Вместо этого он учредил две должности советников под началом амбаня, сосредоточив всю власть в собственных руках.
