«Хорошо ты сделал, что послал сюда письменные донесения и своего человека: так должны делать все архиереи. Ибо твое святительство в точности знает существующие на этот предмет канонические постановления и предписания, именно ― что все поместные архиереи должны или сами приходить к патриарху и божественному и священному собору, или, когда это для них неудобно, присылать от себя грамоты и людей, донося и спрашивая, о чем нужно. Сначала божественные и священные каноны предписывали нашим архиереям приходить сюда дважды в год; потом некоторые из позднее сошедшихся святых архиереев, по вниманию к отдаленности места и человеческой немощи, постановили (сходиться на собор) однажды в год. Итак, я получил грамоту твоего святительства и похвалил тебя: делай так и впредь; а лучше, если будет удобно, приходи сам; в противном случае ― пиши, доноси и спрашивай о всем, в чем имеешь нужду, о церковных потребностях, о делах государственных, о всем, о чем хочешь: и ты сначала получишь наставление по своим недоумениям и вопросам, потом узнаешь о всех здешних делах ― церковных, государственных и царских».
Филофей состоял в переписке и с великим князем московском Дмитрием. В том же, 1370 г. патриарх отвечает на послание князя:
«Я узнал и известился о всем, что ты сообщаешь и пишешь, и возблагодарил Бога о твоем добром здравии и о том, что твои дела и правление идут хорошо. По долгу, лежащему на мне, как общем отце, свыше от Бога поставленном для всех повсюду находящихся христиан, я всегда пекусь, подвизаюсь и молю Бога о их спасении, но в особенности делаю это по отношению к вам, к находящемуся там святому народу Христову, зная, какой имеют они страх к Богу, любовь и веру. Да, я молюсь о вас и люблю вас всех предпочтительно пред другими; но всего более люблю твое благородие и молюсь о тебе, как о своем сыне, за твою любовь и дружбу к нашей мерности, за искреннюю преданность святой Божией Церкви, за благорасположение и повиновение к брату и сослужителю нашей мерности…»
Это не просто лесть; после того как сербская и болгарская церкви объявили себя независимыми от Константинополя, Московия, последняя из крупных государственных образований, продолжала хранить верность старшей сестре и принимать митрополита, назначаемого Константинопольским патриархом.
Константинопольский патриарх зорко следит за тем, чтобы на Руси соблюдались все каноны православия. Строгого выговора Филофея удостоился епископ Новгорода, украсивший свою фелонь четырьмя крестами и надменно разговаривавший с вышестоящими лицами:
«Между тем мерность наша узнала, что ты, вопреки каноническому порядку и обычаю, взял то, на что не имеешь никакого права, и также носишь на своей фелони четыре креста. И не только в этом ты виновен, но и в том, что не оказываешь надлежащего почтения, повиновения и благопокорения к преосвященному митрополиту киевскому и всея Руси,… ни к сыну моему, благороднейшему князю всея Руси кир Димитрию, но противишься и противоречишь им. Узнав о сем, мерность наша тяжело огорчилась, разгневалась и вознегодовала на тебя за то, что ты делаешь это вопреки божественных и священных канонов. Поэтому пишем и приказываем тебе, чтобы ты беспрекословно и без всяких отговорок сложил кресты со своей фелони: ибо как ты дерзнул сделать для себя таковое дело?»
Филофей активно вмешивается в русскую внешнюю политику, он даже пытается организовать нечто вроде крестового похода против Литвы. Константинопольский патриарх отлучает от церкви князей, не поддержавших московского князя; досталось и литовцам.
Персональную отлучительную грамоту патриарх отправил смоленскому князю Святославу, который выступил на стороне литовцев. Филофей строг, но он указывает путь искупления вины:
«Итак, хорошо сделал митрополит, что отлучил тебя: ибо ты совершил тяжкий грех против своей веры и своего христианства; поэтому и мерность наша имеет тебя отлученным за то злое деяние, и ты тогда только можешь получить от нас прощение, когда сознаешь, какое сделал зло, обратишься и раскаешься искренно и чистосердечно, и со слезами прибегнешь к своему митрополиту, прося у него прощения, и когда (митрополит) напишет (об этом) сюда к нашей мерности. Знай же, что отлучение удаляет и совершенно отчуждает человека от святой Божией Церкви, и умершее тело его, человека отлученного, остается неразрушимым в обличение его злого деяния. Итак, позаботься и попекись, чтобы искренно раскаяться и сознать свое прегрешение; и когда ты, вместе с митрополитом, напишешь сюда и будешь просить прощения, тогда и от нашей мерности получишь прощение и разрешение от греха и удостоишься молитв и похвал; тогда и Бог простит тебя, в чем ты согрешил пред Ним, и будет твоим Помощником в княжении и во всей жизни».