Чтобы еще больше укрепить политические связи, Гуши-хан обратился к императорскому двору Цин с просьбой «пригласить достойного Далай-ламу в Пекин, чтобы тот пел сутры благословения». Пятый Далай-лама Лобсан Гьяцо уехал из Лхасы в 1652 году в сопровождении большой свиты и прибыл в Пекин в конце того же года. Он получил аудиенцию у императора Шуньчжи в Наньюане близ Пекина, там с гостем обращались с особым пиететом, устроили в его честь банкет, а также вручили в дар золото, серебро, атлас, драгоценные камни и нефрит. Тибетский религиозный лидер, в свою очередь, отплатил щедрой данью, состоящей из кораллов, янтаря, ляпис-лазури, ткани пулу, лошадей и меха ягненка. Во время двухмесячного пребывания в Пекине император Шуньчжи дважды вызывал его в Запретный город для участия в грандиозных государственных банкетах и приглашал на многочисленные обеды, устраиваемые маньчжурскими и монгольскими князьями. Далай-лама проводил буддийские мероприятия: трактовал священные писания, составлял приглашения, пожелания, панегирики и молитвы для монгольского принца Хорчина, монахов хань, императорской гвардии и тысяч простых людей со всей страны. Он также получил в подарок деньги и буддистские ритуальные принадлежности.
Императорский двор династии Цин построил Желтый храм, который служил резиденцией Далай-ламы в Пекине. В начале 1653 года император Шуньчжи даровал ему императорский мандат, золотую печать и титул
Гуши-хан умер в 1654 году. Два его сына боролись за трон в течение четырех лет. Им удалось достигнуть компромисса, и Таши Батур был назначен председателем Хошута в Цинхае, а Даян-хан получил право на управление У и Цангом. Однако они не пользовались таким уважением и не славились такой мудростью, как их отец. Далай-лама V, напротив, приобрел больше власти и уважения при поддержке династии Цин.
В 1658 году умер дези Сонам Рабтен, назначенный Гуши-ханом. После двух лет переговоров Далай-лама назначил своим доверенным лицом Дронгмепу Тринлей Гьяцо. В дальнейшем монгольские ханы делегировали Далай-ламе право назначать дези. После смерти Панчен-ламы IV в 1662 году политическая и религиозная власть Тибета еще больше сосредоточилась на Далай-ламе. Однако Гелугпа по-прежнему нуждалась в военной защите Хошута. Ханство не имело правителя в течение трех лет после смерти Даян-хана в 1668 году. Тензин Далай-хан вступил на престол в 1671 году. Далай-лама V намеревался привести к власти Сангье Гьяцо, племянника Дронгмепы Тринли Гьяцо. Он выдвинул 24-летнего Сангье Гьяцо на пост дези в 1676 году, но сам кандидат отклонил данное предложение. Вместо него это место на три года занял Ловзанг-Чинпа, меход-дпон (ответственный за воспевание сутр и жертвоприношения) Далай-ламы. Три года спустя Сангье Гьяцо все же принял предложенную Далай-ламой должность. Когда Далай-лама V скончался в 1682 году, Сангье Гьяцо и несколько его приближенных решили пока не сообщать об этом, сославшись на незавершенное строительство дворца Потала и войну с Ладакхом. Однако их истинной целью было сохранение власти. «Они сочинили историю о том, что Далай-лама очень глубоко медитировал в своем доме и не хотел встречаться с людьми. Однако все делалось от его имени». Чтобы получить мандат Центрального правительства Цин на законное правление Тибетом, Сангье Гьяцо в 1694 году обратился к императору с просьбой от имени Далай-ламы V: «Я стар, и большинство тибетских дел фактически находится в ведении дези. Я умоляю Ваше Величество наделить его полномочиями». Император Канси решил присвоить Сангье Гьяцо титул Принца Дхармы и даровать ему печать.
